Название:Генетика вирусов гриппа

Автор:под ред. Пейлиз П., Кингсбери Д. У.

Дата выпуска:1986

Издательство:Медицина

Страниц:336

Язык:русский

Формат:djvu

Качество:среднее

Размер:4.8 Mb

В монографии рассмотрены генетика и молекулярные основы продукции вируса гриппа, его эволюция и эпидемиология. Описаны геном вируса гриппа, транскрипция генома и геномные РНК-сегменты. Представлены данные об антигенной вариации и мутантах вируса гриппа, экспрессии клонированных генов, генетическом базисе вирулентности вируса.
Освещены наиболее крупные пандемии XX века.
Для микробиологов, эпидемиологов, вирусологов, генетиков.

Оглавление: 1. Перспективы развития генетики вируса гриппа. — Э. Кильбурн (Е. Kilbourne) [11]
I. Введение [11]
II. Развитие современной генетики вируса гриппа [12]
A. Первые лабораторные доказательства генетической изменчивости [12]
Б. Применение традиционных генетических методов для изучения вируса гриппа [13]
B. Генетические маркеры [14]
Г. Развитие методов бляшек [15]
Д. Использование условных летальных мутантов [16]
Е. Новые подходы в генетике вируса гриппа [17]
1. Биохимическая идентификация продуктов вирусного гена при нечетком определении вирусного потомства [17]
2. Картирование генома вируса гриппа коррелятивными физико-химическими и биологическими методами [18]
3. Применение методов молекулярной биологии для изучения вирусных генетических изменений [19]
4. Олигонуклеотидное картирование вирусных РНК [19]
5. Роль секвенирования белка и РНК в генетике вируса гриппа — внутригенное картирование [20]
III. Вирусная генетика и понимание вирулентности и патогенности вирусов [20]
IV. Взаимосвязь генетики вируса гриппа с эпидемиологией и эволюцией вирусов гриппа (молекулярная эпидемиология) [21]
A. Генетическое перераспределение в природе и его роль в эволюции новых вирусов [22]
Б. Генетика минорной изменчивости [23]
B. Вирусы гриппа А, В и С [23]
V. Практическое применение генетики вируса гриппа [24]
VI. Специальная генетика вирусов с раздробленным геномом в связи с проблемами гриппа [25]
VII. Нерешенные проблемы гриппа и генетические подходы к их решению [26]
Список литературы [27]
2. Сегменты РНК вируса гриппа и кодированные ими белки.— Р. Лемб (R. Lamb) [31]
I. Введение [31]
II. Частица вируса гриппа: основная структура [31]
III. Структура генома [33]
А. Первые доказательства сегментированности генома [34]
Б. Восемь сегментов РНК вируса гриппа [34]
В. Методы определения функций гена [36]
Г. Последовательности 5'- и З'-концов каждого сегмента РНК — общие [37]
Д. Синтез двунитчатой ДНК с РНК вируса гриппа, клонирование и определение нуклеотидных последовательностей [39]
IV Сегменты РНК вируса гриппа [42]
A. Сегменты 1, 2 и 3 РНК: свойства белков FBI, PB2 и РА, ассоциированных с транскриптазой [42]
Б. Сегмент 4 РНК: структура и функция гемагглютинина [43]
1. Структура сегмента 4 РНК, кодирующего гемагглютинин [44]
2. Трехмерная структура гемагглютинина [46]
3. Синтез гемагглютинина, котрансляционные и посттрансляционные модификации [47]
4. Активация инфекционности кливеджем и слияние in vitro [48]
B. Сегмент 5 РНК: структура белка нуклеокапсида [48]
Г. Сегмент 6 РНК: структура и свойства нейраминидазы [49]
Д. Сегмент 7 РНК: структура и синтез мембранного белка (M1) и неструктурного белка (М2) [52]
Е. Сегмент 8 РНК: структура и синтез неструктурных белков NS1 и NS2 [55]
Ж. Перекрывающиеся кодирующие области, использующие различные рамки считывания у вирусов [58]
Список литературы [58]
3. Транскрипция и репликация вируса гриппа. — Р. Краг (R. Krug) [66]
I. Введение [66]
II. Синтез вирусных мРНК [67]
A. Праймирование клеточными кэппированными РНК—открытие [67]
Б. Праймирование клеточными кэппированными РНК—механизм [69]
B. Роль трех вирусных белков Р на этапах праймирования транскрипции [72]
Г. Окончание транскрипции и добавление поли (А) [77]
Д. Регуляция синтеза вирусной мРНК в инфицированной клетке [78]
Е. Клеточный сайт для синтеза вирусных мРНК [80]
Ж. Роль других функций ядер клеток-хозяев в синтезе вирусной мРНК — сплайсирование и метилирование внутренних А-остатков [84]
III. Синтез транскриптов во всю длину [90]
IV. Синтез вРНК (репликация) [92]
Список литературы [93]
4. Генетическое родство вирусов гриппа (РНК и белок). — К. Шолтиссек (С. Scholtissek) [96]
I. Введение [96]
II. Генетическое родство вирусных РНК [96]
A. Различия в скоростях миграции As сегментов РНК, выявленные методом электрофореза в полиакриламидном геле (ПААГЭ) [96]
Б. Молекулярная гибридизация [98]
1. Прямая, РНК-РНК-гибридизация [98]
2. Конкурентная гибридизация [101]
3. ДНК-РНК-гибридизация [102]
4. Анализ двухцепочечных обработанных нуклеазой S1 гибридных молекул методом ПААГЭ [102]
B. Метод олигонуклеотидного фингерпринта [103]
Г. Секвенирование сегментов РНК [105]
1. Секвенирование (?)Р-концевых меченых РНК частичным расщеплением нуклеазой [105]
2. Секвенирование З'-конца РНК с использованием дидеокси-метода [105]
3. Секвенирование полных сегментов РНК [107]
а) Ген гемагглютинина [108]
б) Ген нейраминидазы [110]
в) Три гена белка Р [110]
г) Ген нуклеопротеида [111]
д) Ген мембранного белка [111]
е) Ген неструктурного белка [113]
III. Генетическое родство вирусных белков [114]
A. Различия в скоростях миграции вирусных белков при ПААГЭ [114]
Б. Триптическое пептидное картирование [115]
B. Прямое Секвенирование [116]
IV. Заключение [117]
Список литературы [118]
5. Антигенные вариации среди вирусов гриппа типа А. Р. Вебстер, В. Лейеер, Г. Эйр (R. Webster, W. Laver, G. Air) [123]
I. Введение [123]
II. Исторические сведения [124]
III. Номенклатура [124]
IV. Химические и физические свойства антигенов [126]
V. Гемагглютинин [128]
A. Выделение и антигенные свойства гемагглютинина [129]
Б. Изменение структуры и антигенности гемагглютинина при низких значениях рН [131]
B. Антигенный дрейф гемагглютинина [132]
Г. Использование моноклональных антител в анализе антигенного дрейфа [133]
Д. Изменение последовательности гемагглютинина вариантов вируса гриппа, отобранных с моноклональными антителами [133]
Е. Расположение антигенных сайтов в 3-D структуре гемагглютинина [136]
Ж. Отбор антигенных вариантов секвенированием [138]
3. Антигенный дрейф гемагглютинина вируса гриппа типа А низших животных [140]
VI. Нейраминидаза [141]
A. Антигенные вариации в нейраминидазе [143]
Б. Селекция вариантов нейраминидазы с моноклональными антителами [144]
B. Антигенный дрейф в нейраминидазах вирусов гриппа типа А низших животных [146]
Г. Механизм антигенного дрейфа [147]
VII. Антигенный шифт [147]
A. Выводы из анализа последовательностей [148]
Б. Возможные механизмы шифтов в штаммах вируса гриппа человека [150]
B. Антигенный шифт среди вирусов гриппа низших животных [151]
VIII. Вариация в нуклеопротеиде [152]
IX. Вариация в матриксном белке [153]
X. Вариация в неструктурных белках [154]
XI. Вариации в белках полимеразы [154]
XII. Каково будущее? [155]
Список литературы [157]
6. Экспрессия клонированных генов вируса гриппа. М. Дж. Гетсинг, Дж. Сэмбрук (M. J. Gething, J. Sambrook) [161]
I. Введение [161]
II. Векторы экспрессии [162]
III. Экспрессия генов вируса гриппа в Е. coli [162]
А. Экспрессия гемагглютинина [163]
Б. Экспрессия белка NS1 [166]
IV. Экспрессия генов вируса гриппа в клетках эукариотов [166]
A. Экспрессия гемагглютинина в клетках обезьян с использованием рекомбинантных SV40 вирусных векторов [166]
Б. Приготовление генов гемагглютинина [168]
B. Конструирование рекомбинантных геномов [168]
Г. Введение рекомбинантных геномов в клетки обезьян и продукция вирусного материала [170]
Д. Анализ гемагглютинина экспрессированного из SV40-НА-рекомбинантных векторов [172]
Е. Количественная оценка гемагглютинина, экспрессированного из рекомбинантных геномов [174]
Ж. Влияние промежуточных последовательностей в транскрипте гемагглютинина рекомбинанта на уровень экспрессии белка гемагглютинина [175]
3. Экспрессия матриксного гена в клетках обезьян с использованием SV40-М-рекомбинантного вируса [176]
И. Кратковременная экспрессия клонированных генов в клетках COS-1 [176]
К. Непрерывная экспрессия гемагглютинина из генов, интегрированных в хромосомы клеток эукариотов [177]
V. Анализ экспрессии белков мутанта гемагглютинина [179]
А. Сигнал-минус гемагглютинина (S-HA) —негликозилированный внутриклеточный белок [179]
Б. Удаление С-терминальной гидрофобной последовательности превращает гемагглютинин в секретированный белок [180]
В. Планы на будущее [184]
Список литературы [185]
7. Мутанты вируса гриппа. — Б. Мэйхи (В. Mahy) [186]
I. Введение [186]
II. Характеристика вирусных мутантов [187]
A. Системы вирус гриппа—клетка [188]
Б. Природа вирусной популяции [188]
B. Скорость естественной мутации [189]
Г. Индукция мутантов [190]
1. Мутагены [191]
Д. Текучесть и реверсия [191]
III. Температурочувствительные мутанты [194]
A. Генетическое взаимодействие и классификация мутантов [194]
Б. Передача ts-повреждений индивидуальным сегментам генома 196]
1. Мутанты из Кембриджа [197]
2. Мутанты из Нью-Йорка и Токио [198]
3. Мутанты из Гессена [198]
4. Мутанты из Москвы [199]
5. Мутанты из Бетезды [199]
6. Заключение [200]
B. Фенотипический анализ температурочувствительных мутантов [200]
1. Предназначенность полипептидов относительно сегментов РНК [201]
2. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 1 РНК [202]
а) Активность транскриптазы вирионной РНК [203]
б) Активность РНК-зависимой РНК-полимеразы экстрактов инфицированных клеток [205]
в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [206]
г) Синтез вирусспецифических полипептидов [210]
д) Заключение [212]
3. Мутанты с повреждениями в сегменте 2 РНК [214]
а) Активность вирионной транскриптазы [214]
б) Активность РНК-зависимой РНК-полимеразы в экстрактах инфицированных клеток [215]
в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [216]
г) Синтез вирусспецифических полипептидов [218]
д) Заключение [218]
4. Мутанты с повреждениями в сегменте 3 РНК [219]
а) Активность транскриптазы вириона [220]
б) Активность РНК-зависимой РНК-полимеразы в экстрактах инфицированных клеток [220]
в) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [220]
г) Синтез вирусспецифических полипептидов [221]
д) Заключение [222]
5. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 4 РНК [223]
6. Мутанты с ts-повреждениями в сегментах РНК, кодирующих нуклеопротеид [224]
а) Активность транскриптазы РНК [224]
б) Синтез вирусспецифической РНК in vivo [225]
в) Синтез вирусспецифических полипептидов [226]
г) Заключение [226]
7. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте РНК, кодирующем нейраминидазу [227]
8. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 7 РНК [228]
9. Мутанты с ts-повреждениями в сегменте 8 РНК [230]
Г. Вакцины, полученные на основе температурочувствительных мутантов [232]
IV. Холодоадаптированные мутанты [233]
V. Мутанты круга хозяев [235]
A. Неусловные мутанты круга хозяев [235]
Б. Условные мутанты круга хозяев [237]
B. Заключение [238]
VI. Мутанты, устойчивые к амантадину [238]
VII. Общие заключения [239]
Список литературы [241]
8. Структура дефектных интерферирующих РНК вируса гриппа и их прогениторных генов.—Д. Нейяк, Н. Сивесабраманъян (D. Nayak, N. Sivasubramanian) [249]
I. Введение [249]
II. Свойства ДИ частиц вируса гриппа [249]
III. РНК ДИ частиц вируса гриппа [250]
IV. Структура генов и белков полимеразы [252]
A. Последовательность нуклеотидов генов полимеразы [252]
Б. Первичная структура белков РВ1 и РВ2 [253]
B. Предсказанные вторичные структуры белков РВ1 и РВ2 [255]
V. Структура ДИ РНК [258]
А. Классы ДИ РНК [258]
Б. Полные последовательности нуклеотидов ДИ РНК [260]
VI. Генерирование ДИ РНК из прогениторных РНК [261]
VII. Транскрипция ДИ частиц вируса гриппа [266]
VIII. Интерференция ДИ вирусами гриппа [268]
IX. Заключение [269]
Список литературы [269]
9. Вирусы гриппа В и гриппа С. Г. Эйр, Р. Компанс (G. Air, R. Compans) [272]
I. Введение [272]
II. Вирус гриппа В [272]
А. Разновидность РНК вируса гриппа В [272]
Б. Белки вируса гриппа В [274]
1. Гемагглютинин [276]
2. Нейраминидаза [277]
3. Матричный белок [279]
4. Неструктурные белки [281]
5. Белки Р [281]
В. Репликация вируса гриппа В [281]
Г. Эпидемиология [282]
Д. Антигенная изменчивость вирусов гриппа В [283]
III. Вирус гриппа С [285]
A. Структура вируса [285]
1. Морфология вирионов [285]
2. Разновидности вирусной РНК [286]
3. Вирусные полипептиды [287]
4. Активности слияния и гемолиза [289]
5. Фермент, разрушающий рецептор [289]
Б. Репликация вируса гриппа С [290]
B. Генетика и эпидемиология [291]
Список литературы [293]
10. Различия в патогенезе гриппозной инфекции, зависящие от вируса. Дж. Шульман (J. Schulman) [296]
I. Введение [296]
II. Методы [297]
III. Различия биологических свойств, связанные с гемагглютинином [299]
IV. Вирулентность для цыплят [301]
V. Нейровирулентность для мышей [303]
VI. Вирулентность для других экспериментальных животных [304]
A. Хорьки [304]
Б. Крысы [304]
B. Мыши [305]
VII. Вирусзависимые различия в других системах [307]
A. Культуры клеток [307]
Б. Выращивание вируса в эмбрионах [307]
B. Чувствительность к амантадину [307]
VIII. Вирулентность для человека [308]
IX. Резюме [310]
Список литературы [310]
11. Молекулярная эпидемиология вируса гриппа. П. Пейлиз, Дж.Юнг (P. Palese, J. Young) [313]
I. Введение [313]
II. Вирусы гриппа А, В и С и связанные с ними заболевания [313]
III. Грипп в XX столетии [314]
IV. Надзор за вирусами гриппа [316]
V. Вирусы H1N1, появившиеся в 1977г. [317]
VI. Молекулярная эпидемиология гриппа у животных [318]
VII. Механизмы, влияющие на изменчивость полевых штаммов вирусов гриппа [319]
A. Точечные мутации [320]
Б. Рекомбинация [323]
B. Делеции/вставки [325]
Г. Повторное появление старых генов [326]
VIII. Перспективы на будущее [326]
Список литературы [327]
Предметный указатель [329]